Urbana naselja zagađuju vode preko svojih kanalizacionih izliva koji se direktno ulijevaju u rijeke, jezera ili mora. U kanalizacionim otpadnim vodama mogu se naći razne organske tečnosti, deterdženti ali i hemijska sredstva jer mnogobrojni manji industrijski  i zanatski objekti svoje otpadne vode priključuju na na kanalizaciju naselja. Otpadne vode od ljudi, životinja  mogu da budu veoma opasne, jer mogu da izazovu bakteriološku zagađenost vode, što dovodi do hidričnih epidemija. Kako ove vode potiču od izlučevina, umivanja, kupanja i  organskih otpadaka hrane te one sadrže veliki broj klica. Među njima se nalaze i one crijevnih, zaraznih virusnih, bakterijskih i parazitskih bolesti. Najveći broj klica se izlučuju preko ljudskih fekalija. U digestivnom traktu čoveka živi 97,5% E coli humanog porijekla i 25% nehumanog, a u spoljašnjoj sredini je obrnuto.

                Komunalne otpadne vode sadrže organske materije u koje spadaju: fiziološke izlučevine ljudi i ostatci hrane, a uz to ima i neorganskih materija koje potiču od sredstva sa pranje, raznih detardženata i čvrstih komada različitog sastava. Sapuni i detardženti su površinski aktivna jedinjenja koja menjaju površinski napon vode i koncentrišu se na površinu vode. Sa promjenom površinskog napona vode menja (smanjuje) se razmena kiseonika sa vazduhom i dalje, zbog smanjenja količine kiseonika u vodi dolazi do izumiranja živog sveta u njoj što opet podstiče anaerobn proces. Sintetičke površinske aktivne materije su postojane u vodi i njihova razgradnja može da potraje i do nekoliko mjeseci. Atmosferske otpadne vode putem padavina, kišnce i otopljenog snijega sa sobom nose razna zagađenja .Atmosferske vode kao i voda za pranje ulica spiraju razne rasute zagađujuće materije i odnose ih u mora, jezera, reke... One najčešće sadrže: sulfate, hloride, nitrate, naftu, ulja, razne otpatke i niz drugih organskih i neorganskih jedinjenja.

             Osim otpadnih voda koje kanalizacionim sistemom dospjevaju u rijeke, zagađenja mogu da potiču i od podzemnih voda ukoliko su one zagađene. Međutim mnogo je gora situacija kada oštećena kanalizacija zagađujuje podzemne vode koje se koriste za piće. Osim otpadnih voda iz domaćinstva u kanalizaciji se mogu naći mnogi drugi zagađujući elementi i jedinjenja koja potiču od raznih radionica, zanatskih radnji i industrija.