Naime, za Aleksandrove vladavine, on nije bio jedini kralj Srbije, jer tu su bili njegovi kralj otac Milan i kraljica majka Natalija, koji su vukli svako na svoju stranu. Srbija je postala
država sa dvojnom upravom i kako je primetio istoričar Živanović u
"Političkoj istoriji": "Umesto jednog talenta rođenog za razaranje, tokom skoro sedam godina Srbija je imala dvojicu."
Pod desetogodišnjom vladavinom poslednjeg Obrenovića, kralja Aleksandra (1893-1903), po navodima
Pašićevog prijatelja, italijanskog diplomate Karla Sforce u knjizi "Nikola
Pašić" iz 1937. godine, osnivač i vođa Radikalne stranke
prošao je kroz najraznovrsnija iskustva: bio je gradonačelnik Beograda, predsednik
Skupštine, predsednik ministarskog saveta,oponumoćeni ministar u Rusiji...
Bio je osuđen (21. maja 1898) i na devet meseci zatvora u Požarevcu zbog uvrede kralja Milana u novinama, jer je kritikovao njegovu politiku oslanjanja na Austrougarsku. Potom je
optužen da je upleten u Ivanjdanski atentat (7. jul 1899) protiv Milana
Obrenovića i 13. septembra 1899. osuđen na pet godina robije, pa odmah pomilovan na intervenciju ruskog imperatora i posredstvom austrougarskog cara, kako navode neki
istoričari. Drugi, pak tvrde da je pomilovanje usledilo zbog Pašićevog priznanja na prekom sudu da je
među radikalima zaista bilo neprijatelja dinastije Obrenović, kako piše
istoričar M. L. Zečević.
Prema njegovim rečima, na Ivanjdan 1899, neki Bošnjak Đura Knežević pucao je na kralja Milana u Beogradu. Kralj Milan i kralj Aleksandar
želeli su da iskoriste taj događaj da unište Radikalnu stranku, pa su odmah
optužili Glavni odbor da su njegovi članovi spremili taj atentat. Istog dana je
proglašeno vanredno stanje i pohapšeni su svi članovi Glavnog odbra koji su se zatekli u Beogradu, dok je
Pašić uhapšen u Požarevcu.
Po oceni istoričara, vladavina poslednjeg potomka Obrenovića, kralja Aleksandra,
počela je državnim udarom, a tako se i završila. Došao je na vlast silom 1893, a 10 godina kasnije oficirska zavera pod Apisovim
vođstvom, iz redova tzv. stajaće vojske njegovog oca, došla mu je glave,
okončavši ubistvom kraljev i kraljičin život i celu dinastiju.
Za 10 godina vladavine, Aleksandar Obrenović je izveo tri državna udara u Srbiji,
ukidajući ustave zemlje. Obrazovao je 12 različitih vlada, svi ministri su postavljani odlukom dvora. Sklopio je brak sa znatno starijom dvorskom damom njegove majke, Dragom
Mašin, koja mu nije podarila potomstvo.
Vođa radikala je, za vreme Aleksandrove vladavine bio i dobrovoljni izgnanik u Abaciji, zato
što je kralju Aleksandru Obrenoviću otvoreno rekao da svojim ševrdanjima i
greškama klike koja ga eksploatiše ide u propast - i svoju i zemlje. U Srbiju se vratio nakon Aleksandrove
ženidbe 1900, kada su 11. septembra te godine na rođendan kraljice Drage pomilovani svi radikali koje je preki sud osudio zbog ivanjdanskog atentata. Godinu dana kasnije u
Beču je umro kralj Milan i sahranjen je u Krušedolu.
Kralj Aleksandar Obrenović i kraljica Draga ubijeni su 29. maja 1903. oko jedan sat posle ponoći. Oficiri, zaverenici su potom predali vlast Jovanu
Avakumoviću, koji je sastavio vladu od ličnosti iz svih stranaka. Ta vlada je preuzela na sebe i kraljevsku vlast, raspustila Narodnu skupštinu imenovanu 19. maja i sazvala staru, koja je ukinula Aleksandrov Ustav iz 1901. i vratila na snagu onaj iz 1888. godine, koji je
delimično promenjen i proglašen Ustavom iz 1903. Nikola Pašić je bio upoznat sa zaverom protiv Aleksandra
Obrenovića, ali nije u nju bio umešan, držao se po strani, kako tvrde
istoričari.
Posle pada dinastije Obrenovića, i povratka dinastije Karađorđević, 12. juna 1903. na tron Kraljevine Srbije u liku
Karađorđevog unuka Petra Prvog, Nikola Pašić, objavljuje u štampi od 26. avgusta
opširnu poslanicu radikalima, u kojoj kaže da je promenom na prestolu u Srbiji
rešeno ustavno pitanje, da je Srbiji obezbeđena parlamentarna vladavina i time sve pogodnosti za mirno privredno i prosvetno razvijanje
države. On još naglašava da sada dolazi na dnevni red "rešenje sudbe naše
braće u Staroj Srbiji (Kosovo i Metohija) i Makedoniji".
Povratak
na predhodnu stranu