Sveti Jovan Krstitelj je zadnje djelo koje je Leonardo naslikao. Na slici se nalazi Jovan Krstitelj koji desnom rukom pokazuje nebo, a lijeva ruka se nalazi na prsima. Ova slika odudara od ostalih, jer je Leonardo uvijek predstavljao religiozne motive sa odredjenom dozom postovanja. U ovoj slici, pak, neki kriticari smatraju da je Jovan Krstitelj nedolicno prikazan za jednog sveca.
Istovremeno, slika je i jedno od njegovih nejnepopularnijih dijela iako je to njegov zadnji rad. U ovoj slici se takodje vidi i sav talenat koji je umjetnik posjedovao pa ipak slika nije toliko prihvacena. Razlog tome sto je Leonardo zaista neobican nacin predstavio Jovana. Tada se postavlja pitanje zbog cega je umjetnik odustao od onog klasicnog. Smatra se da je da Vinci prvobitno slikao andjela koji je postepeno prelazio u Jovana. Ako uporedimo ovu sliku sa svim predstavljanjima anjela, uvidjecamo nevjerovatnu slicnost.
Zagonetni smjesak koji se nalazi na licu Jovana ne govori nam puno. To je onaj isti smjesak kao i kod Mona Lize. Isto tako je zagonetno zasto je ovo Leonardovo djelo nije poznato kao Mona Liza ili Tajna vecera kad je vjerovatno njegovo najosobenije djelo.